Kelas 77-B Akademi Puncak Harapan yang tidak biasa akan mendapat tambahan yang bahkan lebih eksentrik: Chisa Yukizome, seorang alumna dengan gelar Pengurus Rumah Tangga Tingkat Sekolah Tinggi Super — dan guru wali kelas baru mereka. Ceria, bersemangat, dan mampu, Chisa segera mulai memperbaiki perilaku bermasalah siswa dan memperkuat hubungan mereka. Mungkin tidak mudah berurusan dengan beragam murid mulai dari putri dan perawat hingga yakuza dan siswa yang sangat beruntung, tetapi segala sesuatu mungkin terjadi dengan kekuatan harapan.
Sementara itu, Hajime Hinata, seorang anak laki-laki biasa-biasa saja dari Kursus Cadangan sekolah, merindukan bakat. Suatu hari, dia mengadakan pertemuan tak terduga dengan Gamer Tingkat SMA Super 77-B Chiaki Nanami, yang menyajikan kepadanya pandangan hidup baru yang penuh harapan. Namun, tanpa sepengetahuannya, eselon atas sekolah akan melaksanakan proyek jahat yang berpusat di sekitar Hajime yang akan membuat Hope’s Peak — dan seluruh dunia — bertekuk lutut.
Zetsubou-hen menceritakan kehidupan sehari-hari yang dilakukan di akademi pengembangan bakat, dan kegelapan yang mengintai di bawahnya. Saat keputusasaan perlahan-lahan menginfeksi harapan, rencana dijalankan untuk memulai Peristiwa Terbesar, Paling Mengerikan, Paling Tragis dalam Sejarah Manusia, dan akhirnya dimulai.